La Bergerie de Villarceaux a une vocation pédagogique incontournable, à l'attention des enfants, mais également à l'attention des adultes à travers l'organisation de séminaires de travail, de formations ou encore de conférences autour de thématiques liées au développement durable.
Certaines de ces manifestations sont organisées depuis plusieurs années, c'est le cas par exemple de la réunion annuelle du "Groupe de Juin", groupe d'agronomes informel ayant pour but de réfléchir sur le développement durable des territoires ruraux. De même, des étudiants d'Agrocampus Ouest, à l'initiative du Professeur Christian Mouchet, assistent ici à un séminaire sur les systèmes agricoles durables et sur les composantes de la durabilité.
La Bergerie organise également des journées de découverte du territoire et de ces activités autour de différentes thématiques. Citons pour exemples :